名侦探柯南剧场版3世纪末的魔术师

回忆之卵，沙皇尼古拉二世家的宝物，因回忆之卵里边收藏着一张沙皇尼古拉二市一家的照片而显得弥足珍贵。如今这个珍世之宝收藏者为原子家铃木财团。此次，铃木财团准备在大阪铃木集团美术馆内展出这个皇家秘宝。然而，令众人始料未及的是怪盗基德竟于此时寄来一封通知函。怪盗基德在这封通知函里以谜语的方式指出了他盗宝的确切时间。慌了手脚的铃木一家找上了毛利小五郎协助警方侦查此案，而同行的还将会有一直深藏在毛利小五郎幕后的真正侦探高手柯南，他与小兰也一同来到展品现场……
一波未平一波又起，当众人将怪盗基德的盗宝时间解读错误而致使宝物落入怪盗基德之手时，谁都料想不到螳螂捕蝉，黄雀在后的戏码正在背后悄悄酝酿着……前一秒钟怪盗基德刚盗走宝物，后一秒钟怪盗基德竟被中途突然出现的神秘杀手狙击……千钧一发之际柯南用新型滑板追踪夺回宝物。
然而，事情并非到这里就完结了。宝物竟然还有另外一个！而且就藏着某座城堡之中……于是，众人围绕着新一个宝物的所在而展开搜寻行动。与此同时，神秘狙击手也出现在了人群之中……